Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms