Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms