Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms