Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms