Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC88CQ9P219 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms