Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VAPAQ9P0L0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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