Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG3Q9NT62 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms