Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms