Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMMDC1Q9NPL8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms