Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BPIFA1Q9NP55 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms