Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP29Q9HBJ7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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