Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA9Q9BWV2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms