Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms