Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAMP1Q96JM3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms