Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
L3HYPDHQ96EM0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
L3HYPDHQ96EM0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms