Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TM4SF18Q96CE8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms