Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3CQ92520 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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