Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms