Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LCN9Q8WX39 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms