Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DDI1Q8WTU0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms