Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms