Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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