Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms