Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms