Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUDCD3Q8IVD9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms