Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
KCNMB4Q86W47 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms