Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTOP1Q7RTM1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms