Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNE3Q6ZMZ3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms