Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPOCD1Q6ZMY3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms