Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms