Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MCTP1Q6DN14 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms