Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46CQ5VWP2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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