Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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