Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAVIN4Q5BKX8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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