Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFT2D3Q587I9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms