Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms