Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms