Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTLL9Q3SXZ7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTLL9Q3SXZ7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms