Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms