Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL40Q2TBA0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms