Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC57Q2TAC2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC57Q2TAC2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms