Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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CDO1Q16878 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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