Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms