Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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