Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SYPL1Q16563 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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