Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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