Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCOA1Q15788 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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