Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A5Q15758 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms