Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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TAF1AQ15573 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TAF1AQ15573 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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