Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PCOLCEQ15113 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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